Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LARP1Q6PKG0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LARP1Q6PKG0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1Q6PKG0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms