Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc57Q6PHN1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms