Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc36Q6PDM4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms