Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCSAPQ6IQ19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms