Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgfbr2Q62312 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tgfbr2Q62312 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tgfbr2Q62312 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tgfbr2Q62312 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tgfbr2Q62312 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tgfbr2Q62312 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr2Q62312 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tgfbr2Q62312 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tgfbr2Q62312 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms