Protein–RNA interactions for Protein: Q5T011

SZT2, KICSTOR complex protein SZT2, humanhuman

Predictions only

Length 3,432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2Q5T011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZT2Q5T011 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZT2Q5T011 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms