Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Utp18Q5SSI6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp18Q5SSI6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms