Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1lQ5D525 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syce1lQ5D525 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms