Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arap1Q4LDD4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms