Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A6Q14031 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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COL4A6Q14031 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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