Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc7a1Q09143 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms