Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms