Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx1P81068 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx1P81068 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.6 ms