Protein–RNA interactions for Protein: P52875

Tmem165, Transmembrane protein 165, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem165P52875 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem165P52875 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem165P52875 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms