Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cav1P49817 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cav1P49817 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cav1P49817 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cav1P49817 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cav1P49817 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cav1P49817 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms