Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myo1bP46735 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myo1bP46735 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms