Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5DP30049 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5DP30049 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5DP30049 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5DP30049 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5DP30049 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5DP30049 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5DP30049 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5DP30049 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5DP30049 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5DP30049 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms