Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DcnP28654 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DcnP28654 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DcnP28654 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DcnP28654 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DcnP28654 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DcnP28654 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DcnP28654 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DcnP28654 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DcnP28654 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms