Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NdnP25233 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NdnP25233 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NdnP25233 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NdnP25233 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NdnP25233 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NdnP25233 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NdnP25233 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms