Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfyaP23708 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfyaP23708 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms