Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P20040 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P20040 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P20040 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P20040 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P20040 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P20040 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P20040 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P20040 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P20040 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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