Protein–RNA interactions for Protein: P15530

Cd79b, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd79bP15530 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd79bP15530 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms