Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT3P12035 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT3P12035 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT3P12035 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT3P12035 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT3P12035 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT3P12035 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT3P12035 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms