Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nid1P10493 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nid1P10493 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nid1P10493 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nid1P10493 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nid1P10493 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms