Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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