Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3685J3QPP2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3685J3QPP2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms