Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms