Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms