Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r167G3UW71 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms