Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
1500009C09RikD3YYW9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1500009C09RikD3YYW9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms