Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem185aA2AF53 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem185aA2AF53 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms