Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trav12-2A0N8N6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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