Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Prr5l-209ENSMUST00000163762 4159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms