Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tusc2Q9WVF8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tusc2Q9WVF8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms