Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms