Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LAMTOR3Q9UHA4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LAMTOR3Q9UHA4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms