Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms