Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms