Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Pgpep1Q9ESW8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pgpep1Q9ESW8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pgpep1Q9ESW8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pgpep1Q9ESW8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pgpep1Q9ESW8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Pgpep1Q9ESW8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Pgpep1Q9ESW8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Pgpep1Q9ESW8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Pgpep1Q9ESW8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pgpep1Q9ESW8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms