Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms