Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syde1Q9DBZ9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms