Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930556J24RikQ9D4U7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms