Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag1Q9D3E6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms