Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tmem88Q9D0N8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem88Q9D0N8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmem88Q9D0N8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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