Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab27bQ99P58 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms