Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms