Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdk8Q8R3L8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk8Q8R3L8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms