Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
4930507D05RikQ8C9C9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930507D05RikQ8C9C9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms