Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwc2Q8C8N3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms