Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp37Q8C0R0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp37Q8C0R0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp37Q8C0R0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp37Q8C0R0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp37Q8C0R0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp37Q8C0R0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp37Q8C0R0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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